La supremazia di Casey Stoner continua a manifestarsi man mano che il campionato di MotoGP del 2011 va avanti. L'australiano su Honda HRC centra la pole anche per il chiacchierato GP di Motegi, fermando il cronometro sul tempo record di 1:45.267, beffando con un acuto finale il campione del mondo in carica Jorge Lorenzo, secondo con 1:45.523 sulla sua Yamaha.
Completa la prima fila uno dei due compagni di scuderia di Stoner, Andrea Dovizioso, che ottiene il tempo di 1:45.791. Dietro di loro c'è la sequenza formata da Daniel Pedrosa, Ben Spies e Marco Simoncelli, mentre Valentino Rossi dà qualche segnale di ripresa rispetto alle qualificazioni dei GP precedenti, ottenendo il settimo tempo (1:46.467). Per Stoner si tratta della decima pole position stagionale.
